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3기 비소세포암의 혈액 전사체 기반 예후 예측 유전자 서명

  • 이시호 (아주대학교 일반대학원)

초록/요약

배경 및 목적: 3기 비소세포폐암（non-small cell lung cancer, NSCLC） 환자는 동시 항암화학방사선치료（concurrent chemoradiotherapy, CCRT）에도 불구하고 예후가 불량하다. 본 연구는 치료 전후 연속 액체 생검을 통해 CCRT를 받는 3기 NSCLC 환자의 무진행생존（progression-free survival, PFS）을 조기에 예측할 수 있는 혈액 전사체 기반 유전자 서명의 개발 가능성을 탐색하고자 하였다. 방법: CCRT를 받는 3기 NSCLC 환자 9명으로부터 치료 시작 전과 치료 4주차에 말초혈액을 채취하였다. RNA 시퀀싱을 통해 유전자 발현 프로파일을 확보하고, 치료 전후 대응되는 샘플 간의 차등 발현 유전자（differentially expressed gene, DEG）를 분석하였다. 선별된 DEG를 대상으로 LASSO-Cox 회귀분석을 수행하여 PFS와 연관된 후보 유전자 서명을 도출하고 그 성능을 평가하였다. 결과: 총 266개의 DEG（상승 166개, 하강 100개）가 식별되었으며, 이들은 주로 세포 주기 및 분열 관련 기능에 유의하게 연관되어 있었다. LASSO-Cox 회귀분석을 통해 최종적으로 SDC2와 TRABD2A로 구성된 2-유전자 서명이 도출되었다. 이 서명 기반의 위험 점수로 환자를 예후가 구분되는 고위험군（n=5）과 저위험군（n=4）으로 분류하였으며, 고위험군은 저위험군에 비해 유의하게 짧은 PFS를 보였다（log-rank p = 0.0049）. 개발된 모델은 해당 코호트 내에서 양호한 예측 성능을 나타냈다（Harrell’s C-index = 0.867; 18개월 시점 time-dependent AUC = 1.00）. 결론: 본 파일럿 연구에서 도출된 혈액 전사체 기반 2-유전자 서명은 CCRT 치료 중인 3기 NSCLC 환자의 진행 위험을 예측하는 동적 바이오마커로서 기능할 가능성이 존재한다.

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목차

I. 서론 1
II. 본론 2
A. 재료 및 방법 2
1. 연구 대상 및 설계 2
2. 시료 채취, RNA 추출 및 시퀀싱 3
3. 데이터 전처리 및 유전자 발현 분석 3
4. 예후 예측 모델 탐색 및 통계 분석 3
B. 결과 4
1. 환자 특성 및 DEG 식별 4
2. 예후 예측 후보 서명 도출 7
3. 모델 성능 평가 9
C. 고찰 15
1. 연구 결과 요약 및 생물학적 기전 15
2. 유전자 서명의 외부 검증 결과 및 면역학적 해석 18
3. 연구의 한계점 및 향후 과제 19
III. 결론 21
참고문헌 22
부록 25

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