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생체분자 분광 분석을 위한 사중극자 이온 포집기-비행시간 (QIT-TOF) 질량 분석기의 구축 및 최적화, 그리고 야누스 키나아제 3의 인산화 여부 및 위치 분석

초록/요약

Our lab has been building an ion trap mass spectrometer with electrospray ionization. Electrospray ionization, time-of-flight measuring set, quadrupole ion trap and vacuum chambers were completed in 2018, and the next facility construction plan is to transfer gaseous ions (which is generated from electrospray ionization) to the quadrupole ion trap and mass analyze them. For this purpose, the construction and test on necessary facility building and upgrade of established facility has been done. In parallel with building quadrupole ion trap-time of flight mass spectrometer, we experimented on identifying a phosphorylation site of Janus kinase 3 and whether it is phosphorylated or not, at Tokyo Institute of Technology, Japan. Janus kinase 3, one of the in vivo phosphorylation involved enzymes, has two successive tyrosines(YY) no. 980 and no. 981. Whether these tyrosines are phosphorylated or not, and also which tyrosine is phosphorylated are identified by UV photofragmentation, H tagging IR-dip, and IR-dip spectroscopy.

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초록/요약

우리 실험실에서는 전기 분무 이온화가 적용된 질량 분석기를 제작해왔다. 2018년에는 전기 분무 이온화, 비행시간 측정기와 사중극자 이온 포집기, 진공실의 설치를 완료하였고 이후 설비구축목표는 전기 분무 이온화로부터 생성한 기체상 이온을 사중극자 이온 포집기까지 끌어온 후 질량 분석을 진행하는 것으로 하였다. 이를 위해 필요한 새로운 장치의 설치와 시험, 기존 장치의 개선을 진행하였다. 사중극자 이온 포집기–비행시간 질량 분석기의 제작과 동시에, 일본 도쿄공업대학에서 야누스 키나아제 3의 인산화 여부 및 위치 분석을 위한 실험도 진행하였다. 체내 인산화관여 효소 중 하나인 야누스 키나아제 3는 980번과 981번의 연속된 두 개의 타이로신(YY)을 가지고 있다. 이 타이로신의 인산화 여부와 어떤 타이로신이 인산화 되었는지를 UV 광분해법, IR-감소법, 수소 표지 IR-감소법으로 확인해보았다.

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목차

제 1 장. QIT-TOF 질량 분석기의 구축 및 최적화 1
1. 배경 및 필요성 1
2. 기존 질량 분석기 개요 5
1) 진공실의 압력과 펌프 6
3. 직류전압 렌즈를 사용한 최적화 7
4. 원 진공실의 압력조절과 스키머, 모세관의 교체 16
1) 스키머의 교체 16
2) 모세관의 교체 20
5. 라디오파 전원장치와 이온가이드의 제작 24
1) 라디오파 전원 장치의 제작 25
2) 이온가이드의 제작 26
6. 새로운 질량 분석기와 전압최적화 36
7. 결론 42
제 2 장. 야누스 키나아제 3의 인산화 여부 및 위치 분석 43
1. 배경 및 필요성 43
2. 연구방법 47
3. 실험 결과(DYYVVR, DYFVVR, DFYVVR) 52
1) 질량 스펙트럼 54
2) UV 광분해 스펙트럼 55
3) IR 스펙트럼 57
4. 결론 61
제 3 장. 마치며 62
참고문헌 63

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