異倍數體 DNA의 CGH 분석에 관한 연구
A study on the CGH analysis of aneuploid DNA
초록/요약
Comparative genomic hybridization(CGH)을 이용하여 종양에 있어 염색체 이상 양상을 규명하는 것은 종양의 발생기전을 연구하는 기초 자료로서 매우 | 유용하다. 본 연구에서는 이배수체 DNA를 가지는 세포에서의 CGH profile 분석을 위해 다섯 종류의 위암 세포주(AGS, SNU-1, SNU-16, SNU-620와 SNU-719)와 다섯 종류의 간암 세포주 (SNU-354, SNU-368, SNU-387, SNU-449와 SNU-475)를 대상으로 하여 CGH와 Flourescence in situl hybridization(FISH) 및 G-banding을 동시에 수행하였다. CGH profile의 분 석을 위해 각 세포주의 modal chromosomal number를 결정하고 각 baseline의 기준이 되는 단일 염색체에서 종양 DNA의 양과 정상 DNA의 양에 대한 형광 비율을 정량적으로 계산한 뒤 그에 따른 각각의 CGH baseline을 결정하였고 각 세포주의 ploidy level에 따른 CGH threshold를 결정하여 분석하였다. 분석결과 이배수체 DNA에서 CGH profile 분석을 위해서는 CGH baseline 의 이동에 따른 CGH threshold를 보정 하여야만 보다 정확한 분석결과를 얻을 수 있었는데 이와 같이 보정된 threshold를 적용한 CGH분석과 CGH 분석결과 를 검증하기 위한 FISH 및 G-banding 결과, 다섯종 류의 위암 세포주에서는 20번 염색체의 장완 (20912-13.2)에서 가장 빈번한 증폭양상을 확인되었고 다섯 종류의 간암 세포주에서는 1번 염색체의 장완(1932-qter)과 7번 염색체 전체의 증폭 양상을 확인된 바 이곳에 존재하는 종양의 발생 기전에 관여하는 유전자에 대한 연구가 필요하리라 사료된다.
more목차
서론 1
본론 3
A. 실험방법 3
1. 대상 3
2. 핵형분석(karyotyping) 3
3. CGH에 의한 염색체의 변이 양상 조사 4
4. F,I,S,H 7
B. 결과 9
1. Aneuploid DNA level에 따른 base line의 이동도 분석결과 9
2. Aneuploid DNA level에 따른 각각의 손실과 증폭의 CGH threshold의 설정 11
3. 보정된 CGH threshold를 이용한 각 세포주의 CGH profile에 의한 세포 유전학적 분석결과 13
4. 각 세포주의 세포유전학적인 분석결과 13
C. 고찰 17
결론 32
참고문헌 33
Abstract 37
